Защитените територии в южните части на Пазарджишка област, попадащи в границите на Родопите, са обявени с цел опазване на определен ландшафт и зони, които са местообитания на голям брой представители на флората и фауната.
Някои от видовете, които могат да бъдат наблюдавани, са реликтни – представители на минали етапи на палеогеографското развитие на района и адаптирали се към съвременните условия. Други са специфични ендемични видове, характерни за различни ограничени зони. В обхвата на пазарджишките защитени територии попадат такива видове, които са ендемити за Балканите, български ендемити (срещащи се само в нашата страна) и локални ендемити като родопските (в т.ч. и в гръцката част на планината) или видове, характерни само за конкретното място.
Защитените територии са обитавани от множество видове, които са застрашени от изчезване или изчезващи, и са в Червената книга на България. Опазването на тези уязвими представители на българската флора и фауна е от критично значение за запазването на видовото разнообразие и устойчивостта на екосистемите в страната.